O Δρ. Φίλιππος Εμμανουήλ συμμετείχε στη συγγραφή πρακτικών οδηγιών για τη βρογχοσκόπηση που επιμελήθηκε η ομάδα εργασίας επεμβατικής πνευμονολογίας της Ελληνικής Πνευμονολογικής Εταιρίας, στην ενότητα "Διαβρογχική βιοψία διά βελόνης για λεμφαδένες του μεσοθωρακίου και ταχεία αξιολόγηση του κυτταρολογικού υλικού". Η καθοδήγηση του βρογχοσκόπου από την ταχεία αξιολόγηση του υλικού με μικροσκόπιο κατά τη διάρκεια της βρογχοσκόπησης οδηγεί σε μείωση των επιπλοκών όπως αιμορραγία ή πνευμοθώρακα λόγω διαβρογχικών βιοψιών και διασφαλίζει την ποιότητα και επάρκεια του υλικού για διάγνωση και περαιτέρω μοριακό-ανοσολογικό έλεγχο για τη χορήγηση σύγχρονων ογκολογικών θεραπειών. 

https://hts.org.gr/assets/epemvatiki%20pneumonologia_odigies_2021.pdf